求学生涯
因东北战事偏紧，黄仁宇被调到东北，出任东北保安司令部少校参谋。但是，他在东北没有呆得太久。1946年6月初，他从长春到沈阳，参加到美国留学的筛选考试，然后到南京参加复试，从1000多名考生中选出约200名军官。考试整整持续了一个星期，内容包括中英文写作、数学、科学和兵法。口试则是由一组美国军官主考，所有考生进场前要先取下勋章。公布结果时，黄仁宇又惊又喜，他和另外15人被送到雷温乌兹要塞，那是美国陆军参谋大学的所在地。
16人一行从上海启航，搭乘运输舰“尚克号”前往美国。在船上他们就开始过美国式的生活。到达加州以后，他们改搭火车东行，雷温乌兹要塞位于堪萨斯州。他们的校长是哲乐中将，第二次大战期间，曾在欧洲带兵，也是五角大楼的重要人物。
在雷温乌兹，黄仁宇等人学习了9个月，和一般文理综合性大学差不多，学期从9月份开始，6月份结束，圣诞节放假两星期。学校里有约300名美国军官就读。他们大多数是中校，很少有上校或少校。盟军的军官约60名，官阶则很杂乱。课程的大部分内容是地图演练，实例都是从陆军的档案中抽出，但经过修正，以利于课堂上使用。
1947年夏天，黄仁宇回到南京。鉴于时局紧张，他们这些从美国回来的军官，都被分配到军校，或者与训练相关的部门。黄仁宇还越级被提升为参谋本部的军官，隶属国防部，主要任务是将美军提供的文献译成中文。
1948年底，黄仁宇从五厅（训练与组织）转到二厅（军事情报），任务是对外国军队和海军武官做简报。1949年初，国民党在大陆的统治已经彻底崩溃。正在这时，同为雷温乌兹毕业生的袁韦兴上校，问黄仁宇是否愿意去东京，因为他刚被任命为驻日代表团的副官，想让黄仁宇当他的助手。事情就此拍板，1949年5月，黄仁宇乘坐“克利夫兰总统号”的头等舱，从香港前往日本横滨。
同月，黄仁宇向驻日代表团报到，因为只是袁韦兴上校的助手，所以工作很轻松，主要负责和盟军最高统帅司令部的联络。如果有中国官员要出差到日本，就通知外交部；如果是其他情况，则转到人事部。
不料到了10月份，驻日代表团团长朱世明将军忽然开除了自己的秘书，并命令黄仁宇去当他的随从副官。面对此种“升职”，黄仁宇一点也不高兴，因为当袁的助手即使是在办公室，他也可以随意地看书，可不坐班时更可以享受很多的闲暇和自由，可担任团长的随从副官，势必就会打断他的个人计划。而且，他还明白，当将军的副官，工作内容就近似于服务员。黄仁宇向袁韦兴上校求情，未得允许，最终只获得继续住在单身营区，而不用搬进将军官邸的自由。
在黄仁宇成为朱将军的副官后不久，知道了所谓的“叶山会议”。驻日团在离东京约80公里的叶山度假镇有个宾馆，作为周末休闲娱乐场所。有些人士在那里说了不该说的话，被告到蒋介石那里。整个事件的影响持续到第二年，结果是朱世明将军辞职，黄仁宇则接到了退伍令。
在日本呆了一段时间后，黄仁宇开始向美国各有名的大学申请入学，最后他选择了密歇根大学，因为密大不仅最先给他录取通知书，而且还认可他在美国陆军参谋大学所修的学分，所以在1952年9月，黄仁宇进入密歇根大学，主修新闻学。
黄仁宇是班上年纪最大的学生，但他学习起来却是最刻苦的，他给自己定下了在两年内取得硕士学位的目标，结果真的实现了。但毕业也就是失业，可以理解，当时的黄仁宇还不会说道地的美语，也不是那种能在规定的时间内迅速写出很多符合报社要求稿件的人，因此要想找新闻界的工作非常难。他试过出版业，但也只是增加了一些被拒绝的尴尬而已。
密大新闻系主任是威斯理?莫勒。黄仁宇说，“我开始注意历史，大半原因是受他影响”。不过，对于这一选择，黄仁宇半开玩笑半认真地说，当时他并没有想到自己会变成历史学家，更没有想到有一天会研究明史，理出一套方法，再将历史投射到现实，证实自己对帝制中国时期的发现，“如果我可以预见这项任务的艰辛，我一定会退避三舍。”
因为要研究历史，黄仁宇的朋友和老师都劝他“你可能要念个博土学位。”有人还说，这最高学位是在大学教书的通行卡。于是，黄仁宇又开始读历史学硕士和博士学位，这一念就是10年。
黄仁宇来美国之前，曾在日本攒了一笔钱，不过这笔钱很快就花光了。据黄仁宇回忆，“时年34岁还是大学生的我，除了学费偶尔可以延后缴纳外，得不到任何单位的帮助”，长期的工读生涯就成为很自然的事。
黄仁宇干过的工作相当多，如电梯服务员、收货员、洗碗工、调酒员、厨房帮工、清洁工、绘图员等。对于这段经历，黄仁宇说，“在酸葡萄心理作祟后，我发现以劳力赚钱会产生一定的满足感。”一天工作两三个小时，在当时足足可以赚到最低生活费，而且除了活动身体外，还可以打破孤独的感觉，能够看到劳动的“成果”直接转换成现金，无论它有多么微薄，都可以说是特权。而这种感觉，在中国就很少体验到。黄仁宇甚至还问过其他从欧洲和中东来的研究生，他们也承认，虽然为期甚短，靠打工赚生活费仍然是令人高兴的事，因为他们在国内也很少有这样的机会。
1964年，黄仁宇在完成博士论文《明代之漕运》后，获历史学博士学位，不久就收到来自伊利诺州的电话，他被南伊利诺大学聘用，成为该校历史系的助理教授，并在此遇到了未来的妻子格尔。
