意志是人对于自身行为的价值关系的主观反映，具体而言，就是人脑对于自身行为的价值率高差的主观反映，其客观目的在于引导主体根据各种行为的价值收益率的多少（即行为价值率高差的大小）来选择、实施、评价和修正自身的行为活动，使主体能够以最少的代价取得最大的收益。
意志活动的运行程序大致可分为五个阶段。
一、价值目标的确立
人在某一时期内通常会有若干价值需要，并在大脑中会形成相应的主观欲望，这些欲望的满足具体表现为某一种价值事物（如食物、金钱、地位或爱情）的获取或价值目标的实现，
其生理机制是：某一种价值目标（或价值需要的目标物）在大脑皮层中所对应的兴奋灶得到锁定和激发。
二、整体规划的设计
人能够针对已经确定的价值目标，设计出一个整体规划，并对各个阶段、各个环节的工作进行安排。由于任何一个价值目标必须通过实施一系列的复杂行为来实现，每个阶段、每个环节的工作可以看作是一个复杂行为，这一系列的复杂行为可以看作是一个超复杂行为，因此整体规划的设计过程实际上就是一个超复杂行为的设计过程，具体而言，就是把多个复杂行为按照不同的结构方式进行排列组合，并计算出每一种排列组合的价值率，然后比较并选择出最大价值率的超复杂行为。
其生理机制是：某一种价值目标在大脑皮层中相应区域的兴奋灶得到激发后，会使人产生强烈的情感体验，这个兴奋灶将对额叶区的若干复杂行为的兴奋灶产生强烈的吸引力，并使之按照一定的结构方式组合成一个新的兴奋灶群，组合的原则是尽可能使合成的兴奋强度达到极大值，从而使各个复杂行为能够协调一致，并产生具有极大值价值率的超复杂行为。这一过程往往会反复多次，然后，把多个具有极大值价值率的超复杂行为进行比较，最后来确定一个具有最大值价值率的超复杂行为作为实现这一价值目标的整体规划。
三、实施细则的制定
整体规划确定以后，对于每一个阶段、每一个环节的工作就需要进行具体安排，这就是实施细则的制定。对于构成超复杂行为的每一个具体的复杂行为，通常需要多个简单行为按照一定的结构方式来协调完成，因此实施细则的制定过程实际上就是每一个复杂行为的设计过程，具体而言，就是把多个简单行为按照不同的结构方式进行排列组合，并计算出每一种排列组合的价值率，然后进行比较，选择出具有最大价值率的复杂行为。
其生理机制是：按照整体规划，某个阶段、某个环节所对应的某种复杂行为，在大脑皮层中相应区域的兴奋灶得到激发后，会使人产生强烈的情感体验，这个兴奋灶将对额叶区的若干简单行为的兴奋灶产生强烈的吸引力，并使之按照一定的结构方式组合成一个新的兴奋灶群，组合的原则是尽可能使合成的兴奋强度达到极大值，从而使各个简单行为能够协调一致，并产生具有极大值价值率的复杂行为。这一过程往往会反复多次，然后，把多个具有极大值价值率的复杂行为进行比较，最后来确定一个具有最大值价值率的复杂行为作为实现整体规划在某一个阶段、某一个环节工作的实施细则。
四、具体行为的落实
实施细则确定以后，对于每一个具体行为需要进行落实。对于构成复杂行为的每一个具体的简单行为，通常需要多个本能动作（无条件反射或一级条件反射）按照一定的结构方式来协调完成，因此具体动作的落实过程实际上就是每一个简单行为的设计过程，具体而言，就是把多个本能行为按照不同的结构方式进行排列组合，并计算出每一种排列组合的价值率，然后进行比较，选择出具有最大价值率的简单行为。
其生理机制是：按照实施细则，每一个简单行为在大脑皮层中相应区域的兴奋灶得到激发后，会使人产生强烈的情感体验，这个兴奋灶将对额叶区的若干本能行为的兴奋灶产生强烈的吸引力，并使之按照一定的结构方式组合成一个新的兴奋灶群，组合的原则是尽可能使合成的兴奋强度达到极大值，从而使各个本能行为能够协调一致，并产生具有极大值价值率的简单行为。这一过程往往会反复多次，然后，把多个具有极大值价值率的简单行为进行比较，最后来确定一个具有最大值价值率的简单行为作为实现实施细则的具体动作。
五、意志动力特性的修正
人对于每个自身的行为动作（超复杂行为、复杂行为、简单行为和本能行为）都有一个意志，由于意志是人对其行为价值率高差的一种主观估计，因此必然存在着或多或少的误差，需要进行不断的修正。
以复杂行为的修正为例，意志的修正程序是：人在实施某个复杂行为之前，总会对相关的所有简单行为的价值率进行分析，并在此基础上对整个复杂行为的价值率产生一个预测值，与人的中值价值率进行比较后，在人的大脑中形成了实施这个复杂行为的意志。在完成这个复杂行为后，人又会对其价值率的实际值与预测值进行对照，如果存在明显的误差，就会对其中一个或多个简单行为价值率的预测值或意志进行修正，修正的优先顺序是：先修正相对不熟悉的、新出现的或相对不明确的简单行为的意志；如果有两个以上不熟悉的简单行为，则先修正低价值层次的简单行为的意志；如果有两个以上不熟悉的低层次的简单行为，则先修正使用规模较大的简单行为的意志。
为了加快意志的修正过程，通常可以对多个简单行为的意志同步进行修正，但修正的幅度将根据以上优先顺序进行调整。修正以后的意志，将投入下次复杂行为之中进行检验；如果某简单行为长期得不到使用，其意志将会逐渐衰减；如果某简单行为的意志在多次实施过程中得到确认，其稳定性将会得到加强。复杂行为的意志修正程序通常要反复进行多次，直至各个简单行为价值率的实测值与预测值基本相同，该复杂行为价值率的实测值与预测值也基本相同，这时复杂行为的意志修正程序才得以完成。
由于任何行为动作都会涉及一个或若干事物，行为动作的价值率在很大程度上取决于它所涉及的所有事物的价值率，因此意志误差在很大程度上产生于情感误差，要修正好意志，必须首先修正好情感。在实际生活中，意志的修正与情感的修正经常同时进行。
